產(chǎn)品名稱:E010050 Uracil-DNA Glycosylase 尿嘧啶糖基化酶
產(chǎn)品型號(hào):
產(chǎn)品特點(diǎn):E010050 Uracil-DNA Glycosylase 尿嘧啶糖基化酶 其作用原理基于:如果在PCR反應(yīng)中以dUTP替代dTTP摻入DNA中,形成了含dU堿基的PCR擴(kuò)增產(chǎn)物,該酶能選擇性斷裂單鏈和雙鏈DNA中U堿基的糖苷鍵,降解該P(yáng)CR擴(kuò)增產(chǎn)物。
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產(chǎn)品介紹:
尿嘧啶DNA糖苷酶(UNG)來源于大腸桿菌重組克隆表達(dá),分子量為25kDa,可催化含尿嘧啶的單鏈和雙鏈DNA釋放游離尿嘧啶。UNG酶對(duì)RNA無活性,主要應(yīng)用于PCR擴(kuò)增產(chǎn)物的防污染。其作用原理基于:如果在PCR反應(yīng)中以dUTP替代dTTP摻入DNA中,形成了含dU堿基的PCR擴(kuò)增產(chǎn)物,該酶能選擇性斷裂單鏈和雙鏈DNA中U堿基的糖苷鍵,降解該P(yáng)CR擴(kuò)增產(chǎn)物。
規(guī)格:1U/μl
儲(chǔ)存緩沖液:
20mM Tris-HCl(pH8.0,25℃),150mM NaCl,1mM EDTA,1mM DTT,0.05% Tween20,50%glycerol.
試劑組成:
10×Reaction Buffer:200mM Tris-HCl(pH8.0,25℃),100mM NaCl,10mM EDTA,1mg/ml BSA.
活性定義:
37℃條件下,1小時(shí)降解1μg含dU堿基的單鏈DNA的酶量為1單位。
保存條件:
每天或每周使用保存于-20℃。長期儲(chǔ)存應(yīng)保存于-70℃保存,并嚴(yán)格避免-70℃保存時(shí)反復(fù)凍融。
質(zhì)量控制:
1、SDS-PAGE電泳純度大于98%;
2、1U UNG在 37℃處理3分鐘后,103拷貝以下含U模版應(yīng)*降解,不能產(chǎn)生擴(kuò)增產(chǎn)物。
3、無核酸外切酶和核酸內(nèi)切酶活性、RNase酶活性;
(1)SDS-PAGE 銀染純度大于98%
(2)UNG 酶消化能力試驗(yàn)
以700bp含dUTP的不同拷貝數(shù)基因片段為模板,分別加入含0.5U UNG酶的50μl PCR反應(yīng)體系,50℃ 消化2min,94℃ 滅活4min后進(jìn)行PCR擴(kuò)增反應(yīng)。
A. Biori UNG
B. Promega UNG
Lane 1:Negative control (no template);
Lane 2:positive control(no UNG);
Lane 3~lane 10: 103 to 1010 copies of template
結(jié)果表明,我們的UNG酶與Promega UNG酶消化效果相當(dāng),均可以有效控制108拷貝以下含有U-DNA的模板的污染。
(3)UNG酶穩(wěn)定性實(shí)驗(yàn)
將UNG酶置于37℃進(jìn)行7天加速試驗(yàn)。以含dUTP的(106、107、108、109 copies/ml)基因?yàn)槟0澹捎煤?/span>dUTP的體系進(jìn)行PCR擴(kuò)增,50μl反應(yīng)體系加入0.5U UNG酶,于50℃消化2min,94℃滅活4min;然后進(jìn)行PCR擴(kuò)增反應(yīng)。以Promega公司UNG酶為對(duì)照,考察UNG酶對(duì)模板的消化效果。
1:negative(No template);
2~9:postive (104、105、106、107、108、109、1010、1011 copies /ml, No UNG);
10~14:control Promega UNG(106、107、108、109、1010 copies /ml);
15~19:Sample UNG(106、107、108、109、1010 copies/ml)。
1~4:Sample UNG(106、107、108、109 copies/ml);
5~8:Control Promega UNG(106、107、108、109 copies/ml);
9:negative (No template);
10~13:Postive (106、107、108、109 copies/ml,No UNG)。
結(jié)果表明,我們的UNG酶與Promega UNG酶穩(wěn)定性相當(dāng),均可以在37℃加速7天,仍保持對(duì)107copies/ml含dUTP模板的消除能力。
反應(yīng)條件:
Component | Volumeper Reaction(μl) | Concentration in Master Mix |
Template | * | < 1μg/reaction |
Primer1 | 1~5 | 0.2~1.0μM |
Primer 2 | 1~5 | 0.2~1.0μM |
d NTPs (replace dTTP for 150μM~600μM dUTP) | 1 | 150μM (dATP、dGTP、dCTP) |
10×PCR Buffer | 5 | 1× |
25mM MgCl2 | 2~8 | 1.0~4.0mM |
Taq(5U/μl) | 0.25 | 1.25U |
UNG(1U/μl) | 0.25 (0.1~0.5) | 0.25U (0.1~0.5U) |
H2O | * | —— |
Total volume | 50μl |
1、Incubate the product for 2 min at 50℃;
2、Inactivate UNG by heating to 95℃ for 5 min.
注意事項(xiàng):
1、避免多次凍融,切勿暴露在溫度波動(dòng)較大之處。溫度波動(dòng)對(duì)產(chǎn)品的穩(wěn)定性有極大影響。
2、尿嘧啶DNA糖基酶可以在PCR反應(yīng)前清除不慎污染的U-DNA分子。為有效防止污染,一個(gè)實(shí)驗(yàn)室必須在所有的PCR反應(yīng)中均使用dUTP作為dNTPs組分之一進(jìn)行擴(kuò)增,使所有擴(kuò)增產(chǎn)物都成為U-DNA。
3、由于不同基因堿基組成不同,因此有些基因?qū)?/span>UNG酶殘留活性十分敏感,如發(fā)現(xiàn)使用UNG 酶影響擴(kuò)增靈敏度,可以嘗試降低UNG酶的用量或?qū)Ψ磻?yīng)體系中dTTP與dUTP的比例進(jìn)行調(diào)整。推薦使用我公司生產(chǎn)的TS-UNG,該酶滅活更加*,可以大大簡(jiǎn)化上述試驗(yàn)過程。
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